Салон «Атома» представлен в двух цветовых решениях — темном и светлом. Для внутренней отделки используются высококачественная и износостойкая экокожа, а также приятная на ощупь ткань.
На передней панели нет дисплеев - остались лишь кнопки переключения режимов движения, дефлектор климат-контроля и перчаточный ящик. Ниже находится полка для смартфонов с беспроводной зарядкой Qi и двумя разъемами Type-C.
Единственный в передней части салона сенсорный экран расположился на ступице руля. Здесь же — ряд физических переключателей. Руль оснащен обогревом.
Особенность конструкции электромобиля — распашные двери, которые обеспечивают удобный проход внутрь. Этому также способствуют отсутствие центральной стойки и плоский пол.
В салоне «Атома» используется атмосферная подсветка. Она синхронизирована с комплексом безопасности ADAS и реагирует на дорожную обстановку. Элементы подсветки расположены на передней панели, в дверях и на потолке. Освещение салона можно настроить под собственные предпочтения.
Объем багажного отсека электромобиля «Атом» составляет 345 литров. При сложенных задних сиденьях этот объем может быть увеличен до 1020 литров.
Передний ряд сидений оборудован электроприводом. Между сиденьями расположен подлокотник с подстаканниками. Подголовники передних сидений выполнены в единой конструкции со спинкой. В спинки интегрированы крепления ремней безопасности. Подлокотник с подстаканниками и дополнительными разъемами Type-C также есть и для заднего ряда. Все сиденья оснащены подогревом. Для установки детского кресла предусмотрены крепления ISOFIX.
Дисплей камеры заднего вида и видеорегистратор встроены в салонное зеркало. На левой передней стойке есть дополнительная камера для идентификации водителя.